Im oberen Bereich der Hauptseite, unter der Überschrift Verwaltete Server, wird eine Liste der Webmin-Server angezeigt, deren Module und Benutzer über dieses Modul verwaltet werden. Um einen Server zu dieser Liste hinzuzufügen, muss dieser zuerst im Modul Webmin-Server registriert werden, wobei ein Benutzername und Passwort für die Anmeldung bei Webmin auf diesem Server hinterlegt werden müssen. Anschließend kann der Server aus der Liste neben der Schaltfläche Server hinzufügen ausgewählt werden.
Nach dem Hinzufügen eines Servers wird überprüft, ob dieser eine unterstützte Version von Webmin (0.985 oder neuer) verwendet und über die erforderlichen Module verfügt. Anschließend werden Listen aller Module, Themes, Benutzer und Gruppen von diesem Server heruntergeladen und lokal zwischengespeichert.
Sobald mindestens ein Symbol unter Verwaltete Server vorhanden ist, können die Schaltflächen unter Webmin-Benutzer und -Gruppen verwendet werden, um Benutzer und Gruppen auf jedem verwalteten Server zu bearbeiten, zu erstellen oder Zugriffssteuerungslisten (ACLs) zu setzen. Neu erstellte Benutzer und Gruppen werden auf allen verwalteten Servern erstellt, während bereits vorhandene Benutzer und Gruppen nur auf den Servern geändert oder gelöscht werden, auf denen sie bereits existieren.
Am unteren Rand der Seite, unter Module und Themes, befinden sich Schaltflächen zum Bearbeiten installierter Module und Themes auf allen verwalteten Servern sowie ein Formular zur Installation neuer Module oder Themes auf allen Servern.